Au sein de toute cellule eucaryote, on trouve différents types d'organites dont les membranes (bicouche lipidique) ont chacune des particularités structurelles (épaisseur et composition moléculaire) et fonctionnelles.

On peut distinguer deux grands groupes:

1) Des organites qui sont en communication les uns avec les autres, dans l'espace et dans le temps. Ils constituent un véritable réseau intracellulaire de membranes délimitant des cavités closes. Ce réseau est constitué du réticulum endoplasmique, de l'appareil de Golgi, des lysosomes, des peroxysomes et de l'enveloppe nucléaire.

  L'organisation entre ces membranes est de deux types:
 - elles peuvent être en continuité les unes avec les autres.
 - elles peuvent échanger certaines régions membranaires par l'intermédiaire de vésicules mobiles (sacs membraneux)

Il faut noter que cet ensemble de membranes internes est lié à la membrane plasmique (externe).


2) Des organites qui sont, au contraire, partiellement autonomes comme les mitochondries et les chloroplastes (chez les végétaux).
 Il faut noter que la membrane plasmique (externe) est liée à cet ensemble de membranes internes.

L'ensemble des caractéristiques des organites des cellules eucaryotes est de:

- Concentrer des réactions enzymatiques. Les mitochondries concentrent l'ensemble des réactions produisant de l'énergie.
- Compartimentaliser des processus métaboliques. Le réticulum endoplasmique et l'appareil de Golgi compartimentent un ensemble de réactions permettant la synthèse, le transport et contrôle de qualité des protéines et des lipides.
- Compartimentaliser les produits qui pourraient être toxiques pour le reste de la cellule. Le peroxisome permet d'éliminer le peroxyde d'oxygène  et autres  métabolites.